学术写作

01 aipoch/open-science 开源AI研究工作台，面向科学研究与Agent工作流。本地优先、模型无关的桌面应用，具备可扩展 Skill、MCP 工具与连接器，支持 Python/R 执行与可追溯产物，可在 macOS、Windows、Linux 上进行可复现研究。The open-source AI research workbench for scientific research and agent workflows. Local-first, model-agnostic desktop app with extensible skills, MCP tools and connectors, Python/R execution and traceable artifacts for reproducible research on macOS, Windows and Linux. 研究执行 实验与代码复现 MCP Agent 智能体 TypeScript 5,492 ★ 02 pedrohcgs/claude-code-my-workflow 一套开箱即用的 Claude Code 学术模板，基于 LaTeX/Beamer + R，支持多 Agent 评审、质量门禁、对抗式 QA 与复现协议。A ready-to-fork Claude Code template for academics using LaTeX/Beamer + R. Multi-agent review, quality gates, adversarial QA, and replication protocols. 研究执行 实验与代码复现 大纲与论文起草排版与论文模板 LaTeX模板写作 Agent 智能体 HTML 1,527 ★ 03 sthamann/tfpt 拓扑不动点理论：由两个公理推导标准模型、α⁻¹ 与宇宙学的机器可验证离散编译器。包含论文、验证套件（Python/Wolfram/Lean）、实验及网站。Topological Fixed-Point Theory: a machine-checked discrete compiler for the Standard Model, α⁻¹, and cosmology from two axioms. Papers, verification suite (Python/Wolfram/Lean), experiments & website. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 Python 452 ★ 04 leipzig/awesome-reproducible-research 精选的可复现研究案例、项目、教程与媒体资源列表。A curated list of reproducible research case studies, projects, tutorials, and media 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 405 ★ 05 hughjonesd/huxtable 一个 R 包，可通过友好、现代的界面创建多种输出格式的样式化表格。An R package to create styled tables in multiple output formats, with a friendly, modern interface. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 R 332 ★ 06 kbroman/steps2rr 走向可复现研究的初步步骤（极简教程）Initial steps toward reproducible research (a minimal tutorial) 研究执行 实验与代码复现 工程化 Ruby 38 ★ 07 paezha/Reproducible-Research-Workflow McMaster 大学地球、环境与社会学院开设的研究生课程 GEOG 712 Reproducible Research Workflow with GitHub and R 的笔记与资源。Notes and resources for graduate course GEOG 712 Reproducible Research Workflow with GitHub and R offered by the School of Earth, Environment and Society at McMaster University 研究执行 实验与代码复现 工程化 HTML +2/周 33 ★ 08 ericluo04/claude-academic-workflow 面向 Claude Code 的学术研究工作流：包含 20 个 skill，覆盖因果推断（DiD、RDD、IV、合成控制、田野实验、设计分流、预注册）、论文阅读、文献综述、参考文献审计、复现包、LaTeX 与 TikZ，并附带带渲染时质量门禁的 Quarto reveal.js 幻灯片系统。Academic research workflow for Claude Code: 20 skills covering causal inference (DiD, RDD, IV, synthetic control, field experiments, design triage, preregistration), paper reading, lit review, bib auditing, replication packages, LaTeX and TikZ, plus a Quarto reveal.js slide system with render-time quality gates. 研究执行 实验与代码复现 文献与引用管理研究设计与方法 ZoteroLaTeXMCP LLM 基础设施 TeX 25 ★ 09 LightconeResearch/lightcone-cli ASTRA 的 Agent 层 —— 面向可复现研究的专用 skills、工作流执行与 HPC/容器管理。Agentic layer for ASTRA — dedicated skills, workflow execution, and HPC/container management for reproducible research 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python 24 ★ 10 EIvimeyCook/READMEBuilder 为 R 语言可复现研究项目生成高质量 README。High quality README generation for reproducible research projects in R. 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 18 ★ 11 zabor-crypto/zaBor 面向行情录制、交易安全与可复现研究的工程工具包。多交易所 kill-switch、带钱包标签的 Hyperliquid 微结构录制器、资金费率 carry 研究栈。Engineering toolkit for market-data recording, execution safety and reproducible research. Multi-exchange kill-switch, wallet-tagged Hyperliquid microstructure recorder, funding-carry research stack. 研究执行 实验与代码复现 安全与风险 Python 15 ★ 12 riffomonas/drought_index 在研究全球干旱状况的同时实践可复现研究方法的项目A project to practice reproducible research practices while studying the state of drought around the world 研究执行 实验与代码复现 工程化 HTML 11 ★ 13 Xiuyiw/CFD-SCIPaper-Agent 作者在环 CLI，支持 CFD 项目状态可追溯、证据感知选题规划与可复现研究工作流。Author-in-the-loop CLI for traceable CFD project state, evidence-aware topic planning, and reproducible research workflows. 研究执行 实验与代码复现 研究设计与方法大纲与论文起草 写作 Agent 智能体 Python +63/周 9 ★ 14 carpentries-incubator/reproducible-research-through-reusable-code-in-1-day "通过可复用代码实现可复现研究" 研讨会课程材料Lesson material for Reproducible research through reusable code workshop 研究执行 实验与代码复现 工程化 6 ★ 15 anas1412/orb-mt5 面向 MetaTrader 5 的可配置开盘区间突破 EA，附带可复现的研究 harness；所有参数均为输入项，兼容 Windows 与 Linux/WineConfigurable opening-range breakout EA for MetaTrader 5, with a reproducible research harness. Every parameter is an input; runs on Windows and Linux/Wine. 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python +2/周 5 ★ 16 Xalzeroph/Noetrium Noetrium：面向 AI agent 的可复现研究基础设施 —— 涵盖实验、模型、环境、证据、恢复、评估与验证。Noetrium: Reproducible Research Infrastructure for AI Agents - experiments, models, environments, evidence, recovery, evaluation, and verification. 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python +7/周 3 ★ 17 Xalzeroph/AnchorBell AnchorBell：以 Rust 为先、仅做 Maker 的 Binance 股票永续交易引擎 —— 可复现研究、历史回测、市场数据回放、受控的 Testnet 执行、风险控制、订单生命周期管理、恢复机制与可观测性。AnchorBell: Rust-First Maker-Only Binance Equity Perpetual Trading Engine - reproducible research, historical backtesting, market-data replay, controlled Testnet execution, risk controls, order lifecycle management, recovery, and observability. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Rust 3 ★ 18 polymtl-reproducible-research/myst_book 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 3 ★ 19 martinezc1/Reproducible-Research-Using-R 通过真实工作流学习实践可复现研究的 R 开放教材An open educational textbook for learning reproducible research in R through practical, real-world workflows. 研究执行 实验与代码复现 工程化 TeX 3 ★ 20 ices-tools-prod/TAF 用于可复现研究的透明评估框架Transparent Assessment Framework for Reproducible Research 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 3 ★ 21 Bardakor/The-De-margining-Artifact 可复现研究代码：检验足球预测优势是否依赖于博彩公司去水方法。Reproducible research code testing whether football forecasting edges depend on bookmaker de-margining methods. 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python 3 ★ 22 Yangs-AI/Fresh 让研究资源更易于查找、复用与共享，记录可复现研究的资产。（镜像）Making research resources easy to find, reuse, and share, documenting assets for reproducible research. (Mirror) 研究执行 实验与代码复现 数据与向量库 MDX 2 ★ 23 SDFGAEV/Noetrium Noetrium：面向 AI Agent 的可复现研究基础设施——实验、模型、环境、证据、恢复、评估与验证。Noetrium: Reproducible Research Infrastructure for AI Agents - experiments, models, environments, evidence, recovery, evaluation, and verification. 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python 2 ★ 24 SDFGAEV/AnchorBell AnchorBell：Rust 优先、仅做市商模式的 Binance 股票永续交易引擎——可复现研究、历史回测、行情数据重放、受控 Testnet 执行、风险控制、订单生命周期管理、恢复与可观测性。AnchorBell: Rust-First Maker-Only Binance Equity Perpetual Trading Engine - reproducible research, historical backtesting, market-data replay, controlled Testnet execution, risk controls, order lifecycle management, recovery, and observability. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Rust 2 ★ 25 LONGshenyizu/tox21-research Tox21 多终点毒性预测：可复现的研究与推理制品（冻结模型、FastAPI 服务、已审计的安全机制）Tox21 multi-endpoint toxicity prediction: a reproducible research and inference artifact (frozen model, FastAPI service, audited security) 研究执行 实验与代码复现 LLM 基础设施 Python 2 ★ 26 kbhalajiyadav/lab-research-code-template 面向可复现研究代码、分析工作流、文档以及可发布实验室软件项目的模板仓库Template repository for reproducible research code, analysis workflows, documentation, and release-ready lab software projects. 研究执行 实验与代码复现 模板 工程化 2 ★ 27 akaieuan/akaOSS akaOSS studio——五个面向人在回路 AI 测量与开发者工具的开源项目，Assist-Not-Complete 论文，可复现研究信息流，以及 HITL Kit 的 shadcn registry。站点 akaoss.dev。The akaOSS studio — five open-source projects for human-in-the-loop AI measurement and developer tooling, the Assist-Not-Complete paper, a reproducible research feed, and the HITL Kit shadcn registry. Live at akaoss.dev. 研究执行 实验与代码复现 写作 评测基准 TypeScript 2 ★ 28 souvikDevloper/kvbridge 面向生产环境的、有内存约束的跨模型 KV-cache 传输，具备受保护的回退机制与可复现研究工具链。Production-oriented, memory-bounded cross-model KV-cache transfer with guarded fallback and reproducible research tooling. 研究执行 实验与代码复现 LLM 基础设施 Python 1 ★ 29 Roblis0n/Bertopic-tuning 语义优先的 Codex skill，用于可审计的 BERTopic 调参、主题解释、模型比较与可复现研究交付。Semantic-first Codex skill for auditable BERTopic tuning, topic interpretation, model comparison, and reproducible research delivery. 研究执行 实验与代码复现 Skill RAG 检索增强 Python 1 ★ 30 RentoSaijo/CSAx 提交至 Carnegie Mellon Sports Analytics Conference 2026 可复现研究竞赛的作品。Submission for Carnegie Mellon Sports Analytics Conference Reproducible Research Competition 2026 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 1 ★ 31 imReese/Karkinos 本地优先的量化投资平台，支持可复现研究、证据约束决策、风险控制、论文/影子验证以及人工监督执行Local-first quantitative investing platform for reproducible research, evidence-bound decisions, risk controls, paper/shadow validation, and human-supervised execution. 研究执行 实验与代码复现 写作 Agent 智能体 Python 1 ★ 32 HmZ9874/umd-planetary-memory UMD 行星长期记忆算法、公式、基准、SDK 与可复现研究。UMD planetary long-term memory algorithms, formulas, benchmarks, SDKs, and reproducible research 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python 1 ★ 33 HellYeahwuli/Edge-ECG-Digital-Service-Loop-IoT- 面向互联医疗 IoT 中可审计的两级本地—边缘 ECG PVC 风险服务回路的可复现研究代码Reproducible research code for an auditable two-tier local-edge ECG PVC risk service loop in connected healthcare IoT. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 1 ★ 34 GengisK4hn/sars-cov-2-vaccine-codon-analysis "生物信息学分析揭示 COVID-19 mRNA 疫苗与自然 SARS-CoV-2 变异株之间的人工密码子偏好变化"。SARS-CoV-2、COVID-19、vaccine、codon-optimization、bioinformatics、sequence-analysis、mRNA-vaccine、origin-analysis、reproducible-research。"Bioinformatics analysis revealing artificial codon preference changes in COVID-19 mRNA vaccines vs natural SARS-CoV-2 variants" SARS-CoV-2, COVID-19, vaccine, codon-optimization, bioinformatics, sequence-analysis, mRNA-vaccine, origin-analysis, reproducible-research 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 1 ★ 35 Fatma3598/EEG-Imagined-Speech-Preprocessing-Generalization 《Comparative Analysis of EEG Signal Preprocessing Impact on Generalization of a Transformer-Based EEG Imagined Speech Recognition》研究的可复现研究仓库。Reproducible research repository for 'Comparative Analysis of EEG Signal Preprocessing Impact on Generalization of a Transformer-Based EEG Imagined Speech Recognition' research work 研究执行 实验与代码复现 多模态 Jupyter Notebook 1 ★ 36 docxology/template_autoscientists AutoScientists：确定性的多 agent 科学发现协调框架 —— docxology/template 可复现研究范式的公开范例（测试覆盖率 ≥90%，无 mock，GitHub 与 Zenodo 10.5281/zenodo.20533669 双重发布）。AutoScientists: a deterministic multi-agent scientific-discovery coordination harness — public exemplar of the docxology/template reproducible-research paradigm (≥90% test coverage, no mocks, double-published GitHub + Zenodo 10.5281/zenodo.20533669). 研究执行 实验与代码复现 模板 Agent 智能体 HTML 1 ★