学术写作

01 Galaxy-Dawn/claude-scholar 面向学术研究与软件开发的半自动研究助手，支持 Claude Code、Codex CLI、Kimi Code CLI 与 OpenCode，覆盖构思、编码、实验、写作与发表全流程。Semi-automated research assistant for academic research and software development. Supports Claude Code, Codex CLI, Kimi Code CLI, and OpenCode across ideation, coding, experiments, writing, and publication. 研究执行 研究设计与方法 写作 Agent 智能体 Python +21/周 5,067 ★ 02 OpenNSWM-Lab/FAROS 由蓝图驱动的 AutoResearch 运行时，用于编排 AI 科研工作流，涵盖创意生成、实验、论文写作与同行评审。A blueprint-driven AutoResearch runtime for orchestrating AI research workflows from idea generation and experiments to paper writing and peer review. 研究执行 研究设计与方法 大纲与论文起草同行评审与 Rebuttal 写作 Agent 智能体 Python 3,041 ★ 03 pedrohcgs/claude-code-my-workflow 一套开箱即用的 Claude Code 学术模板，基于 LaTeX/Beamer + R，支持多 Agent 评审、质量门禁、对抗式 QA 与复现协议。A ready-to-fork Claude Code template for academics using LaTeX/Beamer + R. Multi-agent review, quality gates, adversarial QA, and replication protocols. 研究执行 实验与代码复现 大纲与论文起草排版与论文模板 LaTeX模板写作 Agent 智能体 HTML 1,527 ★ 04 sthamann/tfpt 拓扑不动点理论：由两个公理推导标准模型、α⁻¹ 与宇宙学的机器可验证离散编译器。包含论文、验证套件（Python/Wolfram/Lean）、实验及网站。Topological Fixed-Point Theory: a machine-checked discrete compiler for the Standard Model, α⁻¹, and cosmology from two axioms. Papers, verification suite (Python/Wolfram/Lean), experiments & website. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 Python 526 ★ 05 leipzig/awesome-reproducible-research 精选的可复现研究案例、项目、教程与媒体资源列表。A curated list of reproducible research case studies, projects, tutorials, and media 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 402 ★ 06 WenyuChiou/ai-research-skills 面向研究工作流的通用 SKILL.md 目录：覆盖文献综述、研究设计、项目记忆、稿件写作与跨 Agent 委托，兼容 Claude Code、Codex、Gemini、Cursor、OpenClaw 及通用 AI 客户端Universal SKILL.md catalog for research workflows: literature review, research design, project memory, manuscript writing, and cross-agent delegation for Claude Code, Codex, Gemini, Cursor, OpenClaw, and generic AI clients. 研究执行 研究设计与方法 系统综述大纲与论文起草 Skill写作 Agent 智能体 Python +7/周 202 ★ 07 OpenRaiser/PaperFlow 📚 PaperFlow：动态个性化的科学论文推荐、阅读与报告生成📚 PaperFlow: Dynamic personalized scientific-paper recommendation, reading, and reporting 研究执行 研究设计与方法 论文推荐与学术图谱 写作 RAG 检索增强 Python 148 ★ 08 drshahizan/research-design 本课程涵盖从初始想法到正式学术写作的开发流程与实现要点。学生将学习如何转化与消化文献综述，从而凝练出拟定的研究题目。This course will cover the fundamental steps and implementation on developing the initial ideas to formal academic writing accordingly. Students will be given the mechanisms on how to transform and digest the literature reviews that leads to the proposed title. 研究执行 研究设计与方法 系统综述大纲与论文起草 写作 工程化 Jupyter Notebook 96 ★ 09 kbroman/steps2rr 走向可复现研究的初步步骤（极简教程）Initial steps toward reproducible research (a minimal tutorial) 研究执行 实验与代码复现 工程化 Ruby 38 ★ 10 LightconeResearch/lightcone-cli ASTRA 的 Agent 层 —— 面向可复现研究的专用 skills、工作流执行与 HPC/容器管理。Agentic layer for ASTRA — dedicated skills, workflow execution, and HPC/container management for reproducible research 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python +1/周 20 ★ 11 zabor-crypto/zaBor 面向行情录制、交易安全与可复现研究的工程工具包。多交易所 kill-switch、带钱包标签的 Hyperliquid 微结构录制器、资金费率 carry 研究栈。Engineering toolkit for market-data recording, execution safety and reproducible research. Multi-exchange kill-switch, wallet-tagged Hyperliquid microstructure recorder, funding-carry research stack. 研究执行 实验与代码复现 安全与风险 Python 15 ★ 12 riffomonas/drought_index 在研究全球干旱状况的同时实践可复现研究方法的项目A project to practice reproducible research practices while studying the state of drought around the world 研究执行 实验与代码复现 工程化 HTML 11 ★ 13 martinezc1/Reproducible-Research-Using-R 通过真实工作流学习实践可复现研究的 R 开放教材An open educational textbook for learning reproducible research in R through practical, real-world workflows. 研究执行 实验与代码复现 工程化 TeX 3 ★ 14 ices-tools-prod/TAF 用于可复现研究的透明评估框架Transparent Assessment Framework for Reproducible Research 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 3 ★ 15 Bardakor/The-De-margining-Artifact 可复现研究代码：检验足球预测优势是否依赖于博彩公司去水方法。Reproducible research code testing whether football forecasting edges depend on bookmaker de-margining methods. 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python 3 ★ 16 Yangs-AI/Fresh 让研究资源更易于查找、复用与共享，记录可复现研究的资产。（镜像）Making research resources easy to find, reuse, and share, documenting assets for reproducible research. (Mirror) 研究执行 实验与代码复现 数据与向量库 MDX 2 ★ 17 polymtl-reproducible-research/myst_book 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 2 ★ 18 LONGshenyizu/tox21-research Tox21 多终点毒性预测：可复现的研究与推理制品（冻结模型、FastAPI 服务、已审计的安全机制）Tox21 multi-endpoint toxicity prediction: a reproducible research and inference artifact (frozen model, FastAPI service, audited security) 研究执行 实验与代码复现 LLM 基础设施 Python 2 ★ 19 kbhalajiyadav/lab-research-code-template 面向可复现研究代码、分析工作流、文档以及可发布实验室软件项目的模板仓库Template repository for reproducible research code, analysis workflows, documentation, and release-ready lab software projects. 研究执行 实验与代码复现 模板 工程化 2 ★ 20 akaieuan/akaOSS akaOSS studio——五个面向人在回路 AI 测量与开发者工具的开源项目，Assist-Not-Complete 论文，可复现研究信息流，以及 HITL Kit 的 shadcn registry。站点 akaoss.dev。The akaOSS studio — five open-source projects for human-in-the-loop AI measurement and developer tooling, the Assist-Not-Complete paper, a reproducible research feed, and the HITL Kit shadcn registry. Live at akaoss.dev. 研究执行 实验与代码复现 写作 评测基准 TypeScript 2 ★ 21 souvikDevloper/kvbridge 面向生产环境的、有内存约束的跨模型 KV-cache 传输，具备受保护的回退机制与可复现研究工具链。Production-oriented, memory-bounded cross-model KV-cache transfer with guarded fallback and reproducible research tooling. 研究执行 实验与代码复现 LLM 基础设施 Python 1 ★ 22 Roblis0n/Bertopic-tuning 语义优先的 Codex skill，用于可审计的 BERTopic 调参、主题解释、模型比较与可复现研究交付。Semantic-first Codex skill for auditable BERTopic tuning, topic interpretation, model comparison, and reproducible research delivery. 研究执行 实验与代码复现 Skill RAG 检索增强 Python 1 ★ 23 khoman9874/research-skills-guide 提供提案撰写、医学影像文献综述与论文报告幻灯片的工具，自动化学术研究工作流。Automate academic research workflows with tools for proposal writing, medical imaging literature reviews, and paper presentation slides. 研究执行 研究设计与方法 系统综述 MCPSkill写作 Agent 智能体 1 ★ 24 imReese/Karkinos 本地优先的量化投资平台，支持可复现研究、证据约束决策、风险控制、论文/影子验证以及人工监督执行Local-first quantitative investing platform for reproducible research, evidence-bound decisions, risk controls, paper/shadow validation, and human-supervised execution. 研究执行 实验与代码复现 写作 Agent 智能体 Python 1 ★ 25 HmZ9874/umd-planetary-memory UMD 行星长期记忆算法、公式、基准、SDK 与可复现研究。UMD planetary long-term memory algorithms, formulas, benchmarks, SDKs, and reproducible research 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python 1 ★ 26 HellYeahwuli/Edge-ECG-Digital-Service-Loop-IoT- 面向互联医疗 IoT 中可审计的两级本地—边缘 ECG PVC 风险服务回路的可复现研究代码Reproducible research code for an auditable two-tier local-edge ECG PVC risk service loop in connected healthcare IoT. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 1 ★ 27 GengisK4hn/sars-cov-2-vaccine-codon-analysis "生物信息学分析揭示 COVID-19 mRNA 疫苗与自然 SARS-CoV-2 变异株之间的人工密码子偏好变化"。SARS-CoV-2、COVID-19、vaccine、codon-optimization、bioinformatics、sequence-analysis、mRNA-vaccine、origin-analysis、reproducible-research。"Bioinformatics analysis revealing artificial codon preference changes in COVID-19 mRNA vaccines vs natural SARS-CoV-2 variants" SARS-CoV-2, COVID-19, vaccine, codon-optimization, bioinformatics, sequence-analysis, mRNA-vaccine, origin-analysis, reproducible-research 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 1 ★ 28 Fatma3598/EEG-Imagined-Speech-Preprocessing-Generalization 《Comparative Analysis of EEG Signal Preprocessing Impact on Generalization of a Transformer-Based EEG Imagined Speech Recognition》研究的可复现研究仓库。Reproducible research repository for 'Comparative Analysis of EEG Signal Preprocessing Impact on Generalization of a Transformer-Based EEG Imagined Speech Recognition' research work 研究执行 实验与代码复现 多模态 Jupyter Notebook 1 ★ 29 docxology/template_autoscientists AutoScientists：确定性的多 agent 科学发现协调框架 —— docxology/template 可复现研究范式的公开范例（测试覆盖率 ≥90%，无 mock，GitHub 与 Zenodo 10.5281/zenodo.20533669 双重发布）。AutoScientists: a deterministic multi-agent scientific-discovery coordination harness — public exemplar of the docxology/template reproducible-research paradigm (≥90% test coverage, no mocks, double-published GitHub + Zenodo 10.5281/zenodo.20533669). 研究执行 实验与代码复现 模板 Agent 智能体 HTML 1 ★ 30 Byt-wyze-technology/Byt-wyze-technology 确定性 SAT API、CNF 预处理工具与可复现研究标准。Deterministic SAT APIs, CNF preprocessing tools, and reproducible research standards. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 1 ★ 31 birdflyi/OSDB_RefQ 开源 DBMS 生态的 Reference Quotient 分析与可复现研究流水线。项目列表每月通过 https://github.com/birdflyi/od_label_issue_gen/tree/main/data/database_repo_label_dataframe 中的 csv 文件更新Reference Quotient analysis and reproducible research pipeline for the open-source DBMS ecosystem. The projects list are updated in the csv files in https://github.com/birdflyi/od_label_issue_gen/tree/main/data/database_repo_label_dataframe monthly. 研究执行 实验与代码复现 数据与向量库 Python 1 ★ 32 apollosbangalu/Research_Group_Work Researcher's Decision Pattern Matrix 仓库，一套用于辅助研究人员（硕士与博士）在选题、研究问题类型、研究设计与方法论方面做决策的文件集合。This is a repository an Researcher's Decision Pattern Matrix, a collection of files to assit researchers (MSc and PhD) in making decisions concerning topic selection, research question type, research design and methodology. 研究执行 研究设计与方法 选题与研究问题 工程化 HTML 1 ★ 33 zach7036/riemann-hypothesis-research 关于 Riemann zeta 零点无条件低重数剖面的未经同行评审的研究，附精确证书，并清晰区分与 RH 相关的探索。不证明 RH。Unrefereed research on unconditional low-multiplicity profiles for Riemann zeta zeros, with exact certificates and clearly separated RH-adjacent explorations. Does not prove RH. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 TeX 0 ★ 34 Yu-Wencheng/LinkPlace-release LinkPlace、LinkPlace-C 与 LinkPlace-M 的可复现研究发布版本。Reproducible research release for LinkPlace, LinkPlace-C, and LinkPlace-M. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 0 ★ 35 Yarra319/reproducible--research--preregistration 可复现的研究问题与预注册Reproducible research question,preregistration 研究执行 实验与代码复现 选题与研究问题 工程化 0 ★ 36 Yanis-Kouidri/DMX-lora-lab 用于 LoRa 与 LoRaWAN 设备实验的 Python 工具包，提供串口通信、自动化工具与可复现的研究实验。A Python toolkit for experimenting with LoRa and LoRaWAN devices, providing serial communication, automation tools, and reproducible research experiments. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 0 ★