学术写作

01 aipoch/open-science 开源AI研究工作台，面向科学研究与Agent工作流。本地优先、模型无关的桌面应用，具备可扩展 Skill、MCP 工具与连接器，支持 Python/R 执行与可追溯产物，可在 macOS、Windows、Linux 上进行可复现研究。The open-source AI research workbench for scientific research and agent workflows. Local-first, model-agnostic desktop app with extensible skills, MCP tools and connectors, Python/R execution and traceable artifacts for reproducible research on macOS, Windows and Linux. 研究执行 实验与代码复现 MCP Agent 智能体 TypeScript 5,492 ★ 02 pedrohcgs/claude-code-my-workflow 一套开箱即用的 Claude Code 学术模板，基于 LaTeX/Beamer + R，支持多 Agent 评审、质量门禁、对抗式 QA 与复现协议。A ready-to-fork Claude Code template for academics using LaTeX/Beamer + R. Multi-agent review, quality gates, adversarial QA, and replication protocols. 研究执行 实验与代码复现 大纲与论文起草排版与论文模板 LaTeX模板写作 Agent 智能体 HTML 1,527 ★ 03 sthamann/tfpt 拓扑不动点理论：由两个公理推导标准模型、α⁻¹ 与宇宙学的机器可验证离散编译器。包含论文、验证套件（Python/Wolfram/Lean）、实验及网站。Topological Fixed-Point Theory: a machine-checked discrete compiler for the Standard Model, α⁻¹, and cosmology from two axioms. Papers, verification suite (Python/Wolfram/Lean), experiments & website. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 Python 452 ★ 04 leipzig/awesome-reproducible-research 精选的可复现研究案例、项目、教程与媒体资源列表。A curated list of reproducible research case studies, projects, tutorials, and media 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 405 ★ 05 hughjonesd/huxtable 一个 R 包，可通过友好、现代的界面创建多种输出格式的样式化表格。An R package to create styled tables in multiple output formats, with a friendly, modern interface. 研究执行 实验与代码复现 LaTeX 工程化 R 332 ★ 06 htlin222/meta-pipe 由 Claude Code 驱动的端到端元分析自动化：AI 辅助文献综述、筛选、提取、分析与稿件生成，面向系统综述和临床证据合成。Claude Code-powered end-to-end meta-analysis automation: AI-assisted literature review, screening, extraction, analysis, and manuscript generation for systematic reviews and clinical evidence synthesis 证据综述 Meta 分析与证据综合 系统综述文献筛选与信息抽取 引用写作 Agent 智能体 Python +10/周 130 ★ 07 kbroman/steps2rr 走向可复现研究的初步步骤（极简教程）Initial steps toward reproducible research (a minimal tutorial) 研究执行 实验与代码复现 工程化 Ruby 38 ★ 08 paezha/Reproducible-Research-Workflow McMaster 大学地球、环境与社会学院开设的研究生课程 GEOG 712 Reproducible Research Workflow with GitHub and R 的笔记与资源。Notes and resources for graduate course GEOG 712 Reproducible Research Workflow with GitHub and R offered by the School of Earth, Environment and Society at McMaster University 研究执行 实验与代码复现 工程化 HTML +2/周 33 ★ 09 ericluo04/claude-academic-workflow 面向 Claude Code 的学术研究工作流：包含 20 个 skill，覆盖因果推断（DiD、RDD、IV、合成控制、田野实验、设计分流、预注册）、论文阅读、文献综述、参考文献审计、复现包、LaTeX 与 TikZ，并附带带渲染时质量门禁的 Quarto reveal.js 幻灯片系统。Academic research workflow for Claude Code: 20 skills covering causal inference (DiD, RDD, IV, synthetic control, field experiments, design triage, preregistration), paper reading, lit review, bib auditing, replication packages, LaTeX and TikZ, plus a Quarto reveal.js slide system with render-time quality gates. 研究执行 实验与代码复现 文献与引用管理研究设计与方法 ZoteroLaTeXMCP LLM 基础设施 TeX 25 ★ 10 LightconeResearch/lightcone-cli ASTRA 的 Agent 层 —— 面向可复现研究的专用 skills、工作流执行与 HPC/容器管理。Agentic layer for ASTRA — dedicated skills, workflow execution, and HPC/container management for reproducible research 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python 24 ★ 11 docxology/template 可复现研究仓库的 GitHub 模板 — 两层 Python 3.10+/uv monorepo，将通用基础设施与各项目代码分离，附带 pytest 覆盖率门槛（基础设施 60%、项目 90%）、17 阶段构建流水线、通过 pandoc/LaTeX 的 markdown-to-PDF 渲染，以及 24 个标准示例。GitHub template for reproducible research repos — two-layer Python 3.10+/uv monorepo splitting generic infrastructure from per-project code, with pytest coverage gates (60% infra, 90% projects), a 17-stage build pipeline, markdown-to-PDF rendering via pandoc/LaTeX, and 24 canonical exemplars. 投稿发表 排版与论文模板 实验与代码复现 PDFLaTeX模板 Agent 智能体 Python 20 ★ 12 Jaxon1216/MathModelHub 美赛/ICM综合准备资源库。包含可复用的数学建模Python代码、LaTeX/Word模板、数据分析笔记本和历年赛题组织。旨在优化竞赛流程，促进可复现研究。A comprehensive toolkit for MCM/ICM preparation. Features reusable Python code for mathematical modeling, LaTeX/Word templates, data analysis notebooks, and organized past problems. Aimed at streamlining the contest workflow and fostering reproducible research. 研究执行 数据与统计分析 实验与代码复现排版与论文模板 LaTeX模板 工程化 +4/周 19 ★ 13 EIvimeyCook/READMEBuilder 为 R 语言可复现研究项目生成高质量 README。High quality README generation for reproducible research projects in R. 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 18 ★ 14 zabor-crypto/zaBor 面向行情录制、交易安全与可复现研究的工程工具包。多交易所 kill-switch、带钱包标签的 Hyperliquid 微结构录制器、资金费率 carry 研究栈。Engineering toolkit for market-data recording, execution safety and reproducible research. Multi-exchange kill-switch, wallet-tagged Hyperliquid microstructure recorder, funding-carry research stack. 研究执行 实验与代码复现 安全与风险 Python 15 ★ 15 u9401066/med-paper-assistant 可审计的 MCP + 跨 Agent 框架，支持自主与人工引导的学术写作——从经验证的证据到已审校的 DOCX/PDF。Auditable MCP + cross-agent harness for autonomous and human-guided academic writing—from verified evidence to reviewed DOCX/PDF. 论文写作 大纲与论文起草 文献与引用管理系统综述 PDF引用MCP Agent 智能体 Python 11 ★ 16 riffomonas/drought_index 在研究全球干旱状况的同时实践可复现研究方法的项目A project to practice reproducible research practices while studying the state of drought around the world 研究执行 实验与代码复现 工程化 HTML 11 ★ 17 Xiuyiw/CFD-SCIPaper-Agent 作者在环 CLI，支持 CFD 项目状态可追溯、证据感知选题规划与可复现研究工作流。Author-in-the-loop CLI for traceable CFD project state, evidence-aware topic planning, and reproducible research workflows. 研究执行 实验与代码复现 研究设计与方法大纲与论文起草 写作 Agent 智能体 Python +63/周 9 ★ 18 eliaswestonfarber/scienceai 一个用于科学文献分析的开源 agentic harness。可协调前沿模型提取数据、复现发现并执行系统综述，具备完整的溯源追踪能力。An open-source agentic harness for scientific literature analysis. Coordinates frontier models to extract data, replicate findings, and perform systematic reviews with full provenance tracking. 证据综述 Meta 分析与证据综合 系统综述文献筛选与信息抽取 引用 Agent 智能体 Python 9 ★ 19 carpentries-incubator/reproducible-research-through-reusable-code-in-1-day "通过可复用代码实现可复现研究" 研讨会课程材料Lesson material for Reproducible research through reusable code workshop 研究执行 实验与代码复现 工程化 6 ★ 20 afsc-gap-products/citations GAP 的引文管理器支持。助力报告、论文、数据和演示的引用！Citation manager support for GAP. This helps with citations for reports, papers, data, and presentations! 阅读管理 文献与引用管理 实验与代码复现大纲与论文起草 引用写作 工程化 TeX 6 ★ 21 anas1412/orb-mt5 面向 MetaTrader 5 的可配置开盘区间突破 EA，附带可复现的研究 harness；所有参数均为输入项，兼容 Windows 与 Linux/WineConfigurable opening-range breakout EA for MetaTrader 5, with a reproducible research harness. Every parameter is an input; runs on Windows and Linux/Wine. 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python +2/周 5 ★ 22 skymanbp/sci-paper Claude Code 插件，用于科学论文写作、带溯源的审稿与去 AI 化改写。12 个 skills + 35 个 tools，遵循统一的类型化标准：不可豁免的完整性阻断器、零目标的 L0 词典、排序的预警以及显式的测量状态，使缺失的校准永远不会被误读为合格。针对 ApJ/MNRAS/PRD/JCAP 稿件进行语料校准。Claude Code plugin for scientific paper writing, source-traced review, and de-AI rewriting. 12 skills + 35 tools under one typed standard: non-waivable integrity blockers, zero-target L0 lexicon, ranked advisories, and explicit measurement states so missing calibration never reads as clean. Corpus-calibrated for ApJ/MNRAS/PRD/JCAP manuscripts. 论文写作 大纲与论文起草 实验与代码复现研究诚信与 AI 写作治理 LaTeX写作 Agent 智能体 Python +1/周 5 ★ 23 fabiocampolim-design/scitech-librarian 一次查询，覆盖全部学术数据库；每次运行归档井然有序。跨 OpenAlex、ADS、arXiv、INSPIRE、Scopus、Semantic Scholar、Crossref 与 WoS 的可复现、合规文献检索One query. Every scholarly database. A tidy archive of every run. Reproducible, ToS-compliant literature search across OpenAlex, ADS, arXiv, INSPIRE, Scopus, Semantic Scholar, Crossref and WoS. 证据综述 系统综述 文献检索与全文获取实验与代码复现 引用 数据与向量库 Python 5 ★ 24 686f6c61/Hermes-Research-PRISMA 一个可复现的 Hermes Agent 研究运行时，用于系统性文献综述、全文证据抽取、方法路由以及可审计的发表产出。A reproducible Hermes Agent research runtime for systematic literature reviews, full-text evidence extraction, methodological routing, and auditable publication artifacts. 证据综述 系统综述 文献筛选与信息抽取实验与代码复现 引用LaTeX Agent 智能体 Python 5 ★ 25 EESH20/science-flake 🔬 用 Science Flake 探索数据科学工作流——一个强大工具，可轻松管理和分享可复现的研究环境。🔬 Explore data science workflows with Science Flake, a powerful tool for managing and sharing reproducible research environments effortlessly. 投稿发表 排版与论文模板 实验与代码复现 模板 工程化 Nix 4 ★ 26 DRZ-hang/StatMate 以证据为先的 agent skill，基于真实研究数据生成可审计的统计分析、诊断、发表级图表、表格与教学报告。Evidence-first agent skill for auditable statistical analysis, diagnostics, publication figures, tables, and teaching reports from real research data. 研究执行 数据与统计分析 科研图表与表格实验与代码复现 可视化Skill Agent 智能体 Python 4 ★ 27 Xalzeroph/Noetrium Noetrium：面向 AI agent 的可复现研究基础设施 —— 涵盖实验、模型、环境、证据、恢复、评估与验证。Noetrium: Reproducible Research Infrastructure for AI Agents - experiments, models, environments, evidence, recovery, evaluation, and verification. 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python +7/周 3 ★ 28 Xalzeroph/AnchorBell AnchorBell：以 Rust 为先、仅做 Maker 的 Binance 股票永续交易引擎 —— 可复现研究、历史回测、市场数据回放、受控的 Testnet 执行、风险控制、订单生命周期管理、恢复机制与可观测性。AnchorBell: Rust-First Maker-Only Binance Equity Perpetual Trading Engine - reproducible research, historical backtesting, market-data replay, controlled Testnet execution, risk controls, order lifecycle management, recovery, and observability. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Rust 3 ★ 29 polymtl-reproducible-research/myst_book 研究执行 实验与代码复现 工程化 Python 3 ★ 30 martinezc1/Reproducible-Research-Using-R 通过真实工作流学习实践可复现研究的 R 开放教材An open educational textbook for learning reproducible research in R through practical, real-world workflows. 研究执行 实验与代码复现 工程化 TeX 3 ★ 31 ices-tools-prod/TAF 用于可复现研究的透明评估框架Transparent Assessment Framework for Reproducible Research 研究执行 实验与代码复现 工程化 R 3 ★ 32 Bardakor/The-De-margining-Artifact 可复现研究代码：检验足球预测优势是否依赖于博彩公司去水方法。Reproducible research code testing whether football forecasting edges depend on bookmaker de-margining methods. 研究执行 实验与代码复现 评测基准 Python 3 ★ 33 Yangs-AI/Fresh 让研究资源更易于查找、复用与共享，记录可复现研究的资产。（镜像）Making research resources easy to find, reuse, and share, documenting assets for reproducible research. (Mirror) 研究执行 实验与代码复现 数据与向量库 MDX 2 ★ 34 SDFGAEV/Noetrium Noetrium：面向 AI Agent 的可复现研究基础设施——实验、模型、环境、证据、恢复、评估与验证。Noetrium: Reproducible Research Infrastructure for AI Agents - experiments, models, environments, evidence, recovery, evaluation, and verification. 研究执行 实验与代码复现 Agent 智能体 Python 2 ★ 35 SDFGAEV/AnchorBell AnchorBell：Rust 优先、仅做市商模式的 Binance 股票永续交易引擎——可复现研究、历史回测、行情数据重放、受控 Testnet 执行、风险控制、订单生命周期管理、恢复与可观测性。AnchorBell: Rust-First Maker-Only Binance Equity Perpetual Trading Engine - reproducible research, historical backtesting, market-data replay, controlled Testnet execution, risk controls, order lifecycle management, recovery, and observability. 研究执行 实验与代码复现 工程化 Rust 2 ★ 36 LONGshenyizu/tox21-research Tox21 多终点毒性预测：可复现的研究与推理制品（冻结模型、FastAPI 服务、已审计的安全机制）Tox21 multi-endpoint toxicity prediction: a reproducible research and inference artifact (frozen model, FastAPI service, audited security) 研究执行 实验与代码复现 LLM 基础设施 Python 2 ★